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09 septembre 2013

The role of AUTS2 in neurodevelopment and human evolution

Traduction: G.M.

Trends Genet. 2013 Sep 2. pii: S0168-9525(13)00129-7. doi: 10.1016/j.tig.2013.08.001. 

Le rôle de AUTS2 dans le développement neurologique et l'évolution humaine

Source

Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, and Institute for Human Genetics, University of California, San Francisco (UCSF), 1550 4th Street, San Francisco, CA 94158, USA.

Résumé

Le gène candidat de susceptibilité à l'autisme 2 (AUTS2) est associé à plusieurs maladies neurologiques, dont l'autisme, et a été désigné comme étant un gène important dans l'évolution humaine spécifique. 
L'analyse fonctionnelle récente de ce gène a révélé un rôle potentiel dans le développement neuronal.

Ici, nous passons en revue la littérature concernant AUTS2, y compris sa découverte, son expression, son association avec l'autisme et d'autres traits neurologiques et non neurologiques, son implication dans l'évolution humaine, sa fonction, sa régulation et les voies génétiques.

Grâce à des progrès dans l'analyse génomique clinique, l'importance médicale de ce gène est de plus en plus évidente, comme l'a souligné cette étude, mais il reste du travail à faire pour découvrir la fonction précise et les voies génétiques associées à AUTS2.

29 janvier 2013

Function and Regulation of AUTS2, a Gene Implicated in Autism and Human Evolution

Traduction: G.M.


 2013 Jan;9(1):e1003221. doi: 10.1371/journal.pgen.1003221. Epub 2013 Jan 17.

Fonction et régulation de AUTS2, un gène impliqué dans l'autisme et l'évolution humaine

Source


Source

Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, University of California San Francisco, San Francisco, California, United States of America ; Institute for Human Genetics, University of California San Francisco, San Francisco, California, United States of America.

Accès à l'intégralité de l'article en anglais


Résumé

Des changements nucléotidiques dans le locus d'AUTS2, dont certains affectent des régions non codantes seulement, sont associés à l'autisme et d'autres troubles neurologiques, y compris déficit de l'attention avec hyperactivité, l'épilepsie, la dyslexie, retard moteur, retard de langage, troubles visuels, une microcéphalie, et la consommation d'alcool. 

En outre, AUTS2 contient la région génomique la plus nettement accélérée différenciant les humains des Néandertaliens, qui est principalement composée de variantes non codantes. 

Cependant, la fonction et la régulation de ce gène restent largement inconnue. 

Pour caractériser la fonction d'auts2, nous l'avons neutralisé chez le poisson zèbre, conduisant à une plus petite taille de la tête, une réduction neuronale, et une diminution de la mobilité. 

Pour caractériser les éléments de régulation d'AUTS2 , nous avons testé des séquences d'activité amplificatrice chez le poisson zèbre et la souris. 

Nous recensé 23 amplificateurs fonctionnels chez le poisson zèbre, dont 10 étaient actifs dans le cerveau. 

Nos tests d'amplificateur chez la souris ont distingué trois exhausteurs de cerveau de souris qui se superpose avec une délétion associée au TSA et quatre amplificateurs de souris localisées dans des régions impliquées dans l'évolution humaine, dont deux sont actifs dans le cerveau. 


Ensemble, nos résultats montrent que AUTS2 est important pour le développement neurologique et met  en évidence des séquences amplificatrices candidates dans lesquelles la variation de nucléotides pourrait conduire à un trouble neurologique et aux traits humains spécifiques.

10 août 2012

Detection of copy-number variation in AUTS2 gene by targeted exonic array CGH in patients with developmental delay and autistic spectrum disorders

Traduction: G.M.

La détection des variations du nombre de copies dans le gène AUTS2 par CGH ciblée sur des zones exoniques chez les patients atteints de retard de développement et de troubles du spectre autistique

Nagamani SC , Erez A , Ben-Zeev B , M Frydman , hiver S , Zeller R , El-Khechen D , L Escobar , Stankiewicz P , Patel A , Wai Cheung S .

Source

Département de génétique humaine et moléculaire, Baylor College of Medicine, Houston, TX, Etats-Unis.

Résumé

Les petits réarrangements génomiques et les variations du nombre de copies (CNVs) impliquant un seul gène ont été associés à des phénotypes neurocognitifs récemment, y compris de nombreuses déficiences intellectuelles (DI), des anomalies comportementales, et des troubles du spectre autistique (TSA).
Ces petites CNV dans le gène candidat de susceptibilité à l'autisme (AUTS2) ont été désignées comme pouvant être associées à des convulsions, des DI et des TSA. 
Nous rapportons le cas de quatre patients avec de petites CNV dont la taille varie entre 133-319 ko qui perturbent AUTS2. Deux patients ont des duplications impliquant des exons simples, tandis que deux autres ont des délétions qui ont supprimé les exons multiples.Tous les patients avaient un retard de développement, alors que deux patients avaient un diagnostic de TSA. 
Les CNV ont été détectés par puce d'hydridation génomique comparative CGH avec une couverture dense oligonucléotide dans les exons de gènes connus ou supposés être responsables de plusieurs phénotypes humains. 

Notre rapport montre en outre que la perturbation de AUTS2 résulte en une variété de phénotypes neurocomportementaux. Plus important encore, il démontre l'utilité de la CGH  ciblée sur zone exonique comme outil hypersensible de diagnostic clinique pour la détection de petits réarrangements génomiques dans les régions cliniquement pertinentes du génome humain.